Pri stanovení stopových prvkov ako As, Cr, V, Fe a Se v morskej vode vysoké koncentrácie zložiek matrice (Na, Mg a chloridové ióny) vytvárajú polyatomické spektrálne interferencie. Z tohto dôvodu je správne stanovenie ich obsahu veľmi obtiažne. Dokonca aj pri prvkoch ako Cd, Tl a Pb, kde nie sú interferencie také problematické, je stanovenie ich obsahov na koncentračnej úrovni ppt a menšej veľmi náročné. Na elimináciu tohto problému sa často používa riedenie vzorky, ktoré však nie je možné použiť pri stanovovaní ultrastopových obsahov prechodových kovov. Nasávanie morskej vody aj zriedenej spôsobuje tvorbu usadenín na kónusoch, môže sa taktiež poškodiť iónová optika, čo má vplyv na stabilitu signálu. Pomocou Triple Cone Interface a Quadrupole Ion Detector v PerkinElmer NexION 300 ICP-MS sa tento problém zmierni. Pre potreby automatizácie náročnej prípravy vzoriek je jedným z najúspešnejších vzorkovací systém sea Fast 3 (Elemental Scientific, Inc.Omaha, NE), ktorý pri použití s optimalizovaným systémom ICP-MS rieši veľa problémov spojených s ultrastopovým stanovením prvkov v morskej vode.